rozvrh COVID-19 pandemický Bol poznačený sériou katastrofických vĺn: šírenie infekcie vrcholí po celom svete, často vedené novo vyvinutými variantmi patogénu, ako sú delta a omikrón.

Takto môže samozrejme prebiehať vírusová evolúcia. ale SARS-CoV-2 Je to nezvyčajne úspešný a nebezpečný vírus; Časť toho, čo tvorí „román“. Koronavírus„Tak pozoruhodná je jeho neustála novinka – nezvyčajne rýchle tempo, ktorým sa zdá, že sa množia nové varianty.

„To, čo sme videli pri variantoch SARS-CoV-2, najmä pri variantoch, ktoré vyvolávajú obavy, je, že prešli oveľa viac mutáciami, ako by sme očakávali pri normálnom evolučnom tempe podobných koronavírusov,“ vysvetliť Sebastian Duchenne je výskumník infekčných chorôb z Inštitútu pre infekciu a imunológiu Petra Dohertyho v Austrálii.

Duchenne zvyčajne poznamenáva, Vírusy Majú tendenciu mutovať relatívne stabilným tempom a môže trvať rok alebo viac, kým sa objaví nový vírusový variant. Zdá sa však, že koronavírus sa tohto kalendára nedrží.

„The delta premennása napríklad objavil len do šiestich týždňov od podoby jeho predkov,“ Duchene hovorí.

pri Nová štúdiaDuchene a jeho kolegovia výskumníci sa snažili zistiť, odkiaľ pochádza tento dramaticky zrýchlený časový rámec.

Analyzovali údaje o sekvencii genómu SARS-CoV-2, aby zistili, ako znepokojujúce premenné (VOC, virulentnejšie línie) môžu byť spojené so zmenami v náhradný kurz vírusu: rýchlosť, ktorou sa v genetickom kóde patogénu objavujú nové mutácie.

Podľa výskumníkov miera zadnej substitúcie SARS-CoV-2 naznačuje, že vírus akumuluje približne dve mutácie za mesiac.

VOC sú však iné zviera, pričom varianty ako Alpha, Beta, Gamma a Delta získavajú veľa mutácií v relatívne krátkych časových rámcoch, z ktorých každá môže zmeniť veci, ako je variantná nákaza, schopnosť replikácie, úroveň kondície atď. .

„Veľký počet mutácií pozorovaných v týchto štyroch VOC je oveľa vyšší, než by sa dalo očakávať podľa fylogenetických odhadov rýchlosti evolúcie nukleotidov SARS-CoV-2,“ vedci Vysvetlenie v ich novináchVedené prvým autorom Johnom Tayom, výskumníkom v oblasti bioinformatiky v Dohertyho inštitúte.

Podľa tímu tajomstvo zrýchlenej mutácie VOC nie je prebiehajúci, prebiehajúci fenomén, ale skôr niečo, čo sa zdá, že sa dočasne vyskytuje vo vývoji vírusu, ku ktorému dochádza krátko predtým, ako sa objavia varianty.

„Našli sme presvedčivé dôkazy, že výskyt VOC podporujú skôr epizodické zvýšenia než dlhé zvýšenia miery substitúcie,“ Tým píše.

Prírastková miera substitúcií je asi štyrikrát vyššia ako odhadovaná miera vývoja pozadia pre SARS-CoV-2, ale analýza naznačuje, že akumulácia mutácií sa vyskytuje v kompaktnom náraze: možno o štyri týždne kratšie pre beta variant a šesť týždňov. pre variant delta.

Iné varianty trvali dlhšie, pretože sa predpokladá, že gama variant sa vyvinul viac ako 17 týždňov, zatiaľ čo alfa si vyžadovala 14 týždňov.

Stáva sa to tak, ale nie sme si úplne istí, prečo k týmto mutáciám vôbec dochádza.

Vedci tvrdia, že vznik prchavých organických zlúčenín je Možno poháňaný prirodzeným výberom. Medzi ďalšie relevantné faktory by mohla patriť infekcia v nezaočkovanej populácii – čo môže uľahčiť šírenie a vývoj vírusu – a pretrvávajúca infekcia u určitých jedincov, ako sú pacienti s oslabenou imunitou, čo môže tiež viesť k Zmena dynamiky vírusu.

Aj keď stále veľa nerozumieme tomu, čo spúšťa toľké rýchle mutácie v SARS-CoV-2, skutočnosť, že môžeme vidieť a sledovať tento výskyt, znamená, že nepretržité genetické monitorovanie vírusu je kritické.

Môže nám to dať šancu zastaviť ďalšiu vlnu – skôr ako ju chytiť.

„To robí dôvod pre genetický dohľad veľmi dobrým, pretože sme nezachytili prechodné formy Omikronu a určite ich bolo málo,“ povedal Duchenne. Sydney Morning Herald.

„Predstavte si, že by ste dokázali odhaliť Omicron u prvých pacientov – ak by ste mohli zastaviť jeho šírenie odtiaľ, neboli by sme v situácii, v akej sa práve nachádzame.“

Výsledky sú uvedené v Molekulárna biológia a evolúcia.